home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00786 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  26 lines
  1. **************************************************
  2. * Photosystem I psaG and psaK proteins signature *
  3. **************************************************
  4.  
  5. Photosystem I  (PSI)  [1]  is  an integral membrane protein complex  that uses
  6. light energy to mediate electron transfer from plastocyanin to ferredoxin. PSI
  7. is found in the chloroplast of plants and cyanobacteria. PSI is composed of at
  8. least 14 different subunits; two of these subunits PSI-G (gene psaG) and PSI-K
  9. (gene psaK)  are  small  hydrophobic  proteins  of  about 7 to 9 Kd  that  are
  10. evolutionary related  [2].  Both  proteins  seem  to contain two transmembrane
  11. regions. Cyanobacteria seem to only encode for PSI-K.
  12.  
  13. As a signature  pattern, we selected the best  conserved region which seems to
  14. correspond to the second transmembrane region.
  15.  
  16. -Consensus pattern: G-F-x-[LIVM]-x-[DE]-x(2)-[GA]-x-[GT]-[SA]-x-G-H-x-[LIVM]-
  17.                     [GA]
  18. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  19. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  20. -Last update: June 1994 / First entry.
  21.  
  22. [ 1] Golbeck J.H.
  23.      Biochim. Biophys. Acta 895:167-204(1987).
  24. [ 2] Kjaerulff S., Andersen B., Nielsen V.S., Moller B.L., Okkels J.S.
  25.      J. Biol. Chem. 268:18912-18916(1993).
  26.